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El delantero alemán perdió mucho protagonismo en el Bayern Munich ante las llegadas de figuras como Luca Toni, Miroslav Klose y Frank Ribery. A tal punto que ya no es más titular.
No tardaron en llegar los rumores de salida, sin embargo, Karl-Heinz Rummenige, presidente del club, rechazó cualquier posibilidad. "Ni lo venderemos ni lo daremos a préstamo" dejó en claro.
En la presente temporada, Lukas Podolski jugó seis partidos (todos comenzando desde el banco de suplentes) y no convirtió ningún gol.